1958年6月7日 广州市人民委员会办公厅发出通知,由广州市卫生局负责筹办广州医学院。9月22日,举行首届学生开学典礼。
1973年10月29日 广州市委决定将市第四人民医院作为广州医学院附属医院。
1979年6月10日 广州市编制委员会发出通知,同意在广州医学院附属医院新医科基础上成立广州呼吸疾病研究所。
1984年9月21日 教育部批准学校内科学(呼吸)、药理学招收硕士研究生。1985年9月4日,首批呼吸内科、药理学硕士研究生正式开学。
1996年2月 时任广州医学院院长钟南山当选为中国工程院院士,这是广东省第一位医药卫生工程院士。
2001年1月2日 国务院学位委员会批准学校成为博士学位授予单位,内科学(呼吸系病)成为新增博士学位授权学科。
2002年底至2003年上半年 以钟南山院士为代表的广医人在抗击非典的战役中勇立潮头,在生与死的考验中,为党和人民交出一份完美的答卷,成为全国抗击非典的一面旗帜。
2003年7月18日 教育部批准广州医学院内科学(呼吸系病)为全国高等学校重点学科。
2006年11月21日 经广州市政府批准,广州医学院新校区建设项目正式立项。
2007年4月2日 广州医学院呼吸疾病实验室被科技部正式批准纳入国家重点实验室建设名单,成为广东地方高校第一个国家重点实验室。
2005年上半年至2007年上半年 教育部在全国高校开展5年一轮的本科教学工作水平评估,学校先后接受了省、教育部组织的专家的评估。2007年4月18日,教育部发出通知,广州医学院获得本科教学工作水平评估优秀成绩。
2010年2月至8月 学校先后获得招收外国来华留学生资格、广东省一本招生资格和硕士研究生推免资格。
2010年11月 作为筹备和运营广州亚运运动员村医疗门诊部的主体,学校承担了亚运会、亚残运会医疗保障任务。
2011年3月22日 学校临床医学获批成为博士学位授权一级学科,基础医学、公共卫生与预防医学、中西医结合等3个学科成为硕士学位授权一级学科;后又批准学校护理学科为硕士学位授权一级学科。
2011年上半年至2013年上半年 学校启动大学更名工作,于2012年12月12日至13日接受了教育部专家组的现场考察。2013年4月23日,教育部发文,正式批准学校更名为广州医科大学。5月18日,广州医科大学正式揭牌,学校发展进入新纪元。
2013年5月 广州医科大学金域检验学院成立。广州医科大学首次与企业合作共建二级学院,进行人才培养模式改革的探索。成为广东省教育改革四个试点学院之一。
2012年下半年至2013年下半年 学校与2011年诺贝尔医学和生理学奖获得者朱尔斯.霍夫曼(Jules A Hoffmann)教授开展合作,2013年10月12日,中法霍夫曼免疫研究所正式揭牌。